一、培训内容
1.河南大学基础医学院网站-河南省核蛋白基因调控国际联合实验室-实验室概况
2.大数据网站:Human Protein Atlas
网站收录了人类蛋白质的基本信息、在细胞和组织中的表达情况以及蛋白质功能等。
1)主界面检索:输入PCNP
2)SUMMARY:蛋白基本信息、表达情况、蛋白功能
3)TISSUE:该蛋白在正常组织中的表达情况
例如下图可见,PCNP蛋白在眼睛中尚未发现存在
4)INTERACTION:与PCNP相互作用的各种蛋白,对这些蛋白按照定位、组织特异性、蛋白类型进行分类标注
5)其他:还可以查阅该蛋白在病理学、免疫学、血液组织、细胞系等方面的内容
3.文献检索:PubMed
1)关键词检索
直接输入关键词,以PCNP为例,直接查阅PCNP,延伸到PEST sequence/nuclear protein,或加限定词proogress/motif/review等,查阅到不同的结果
检索内容 |
时间限定 |
检索结果(篇) |
PCNP |
|
92 |
PCNP progress |
|
6 |
PEST sequence |
5 years |
3780 |
PEST motif |
5 years |
404 |
PEST motif review |
5 years |
16 |
NP |
5 years |
26948 |
NP review |
5 years |
2403 |
… |
|
|
2)高级检索:
选择检索项(作者、主题……)、逻辑关系(AND/OR/NOT)等
检索内容 |
时间限定 |
检索结果(篇) |
NP review[Title] |
5years |
532 |
… |
|
|
3)其他:加时间限定、文献分类、资源类型等,有助于我们更精确地查阅文献
4.如何写综述
综述是对某一主题,分析大量原始数据及文献之后,总结出的一类科学论文。综述内容包括此领域已有结论、研究方法及前沿进展等,能够为研究人员系统而全面地提供相关领域信息。
1)选题并创建大纲
选题是写综述的第一步,要选择个人感兴趣的,且有足够数量的供参考文献,而不是近年来几乎无人研究的话题。参考已有资料,发现新问题,提出创新点,形成自己的文章。
梳理文章结构整理成层层递进且具有逻辑层次的大纲,为我们提供清晰的写作思路,避免文章层次错乱。
2)综述写作
写综述要广泛阅读文献,与命题有关的都要了解,数量在100-200篇。如果要写PCNP,就不能只读PCNP,要读含有PEST序列的蛋白、核蛋白、PCNP与人体器官及疾病的研究等,将几篇文献分为一组,总结文章共性,作为综述的一个论点。
综述要在总结他人研究结果的基础上加入个人的创新点,即文章亮点,例如目前发现PCNP在体内绝大多数器官都有分布,甚至与一些疾病相关,但尚未发现其在眼部有分布,那么PCNP与眼就可以作为创新点来研究。创新点是对先前研究的延伸,而不是凭空的想象,要有立足点且有现实意义。
还要利用软件,制作表格、图表等描述综述中的结论,图表使论点更有说服力,具象性地证明观点。
5.河南省肿瘤精准诊疗产业技术创新战略联盟:Precision.henu.edu.cn
联盟于2022年4月初开始协助主创了河南省首家生物医学英文国际期刊“Gene&Protein in Disease”(GPD),GPD专注于基因、蛋白质和疾病研究最新进展。
二、培训感想
本次培训主要分为三部分内容:大数据、文献检索和综述撰写,这些对于我的后续工作是有很大意义的。
以HPA数据库为例,它包含海量的蛋白质资料信息,更新速度又快。大数据让我们知道某种蛋白、某种基因在人体中的表达情况,让医学工作者能够预测和掌控疾病。由于大数据收集的是全体数据,难免有失精确性,这要求我们有整体思想,从群体现象分析其原因。但值得注意的是,大数据仅作为参考资料,给我们提供研究方向、提供科学问题,但并不是真理,真理要在后续的研究实践中才能得出。正如我们必须通过实验与探索,才能知道PCNP在眼部到底有没有分布,与眼部疾病有无关系。
当我们接触到新的课题,我们首先要广泛阅读文献,大体把握研究内容;然后缩小文献范围,精准阅读,获取有效信息,这就是文献检索的意义。文献检索使我们了解到这个方向之前已经做过什么研究,避免我们重复实验或走弯路;可以直接获取信息,节省科研时间;在先前结论的基础上进行思维发散,找到创新点进行深入研究。文献检索并不是简单的关键词堆砌,很多时候我们需要通过限制时间、确定文献分类、高级检索等,帮助我们查到更新、更准确、更有利的文章。
综述是利用已发表的文献资料为原始素材撰写的论文。可以把“综述”拆解为“综”和“述”,“综”就是综合,围绕课题大范围地读文献,不能局限于课题本身,多角度综合分析课题;“述”是论述,批判性地记述已有成果,另外还要论述自己的思考,不能只是生搬硬套。总而言之,我认为综述写作首先要有较强的理解能力和逻辑思维能力,能读懂并梳理总结先前的论文结论,转化为自己的论点,必要时通过数据、图表来支撑。最重要的是要融入自己的思考,有发现问题的能力,不只是复制先前的理论成果,要从先前成果中得到启发,做出自己的创新性理论成果,举一反三,才算是把这一方面研究透彻。
三、工作设想及未来规划
目前我已明确研究方向,也确定了综述大纲,接下来就要阅读PCNP相关文献,重点研究其与眼部的关系,撰写综述。
围绕PCNP核蛋白,大量查阅文献,之后拓展其与眼部疾病的关系,经过资料比对,决定研究葡萄膜黑色素瘤(UM)与PCNP,因为UM发病率高、预后较差、致死率高,基础和临床资料都比较丰富,肿瘤模型易制备,因此探索PCNP与UM的关系是有意义且可行性较高的。然后再根据导师意见进行修改,直至定稿。
临床医学本科课程涉及多个医学分支,广泛的学习内容有利于我们找准兴趣点,明确未来研究方向,有明确的目标就会更有动力,有更大的可能性在此领域做好做精。眼睛是人体的重要器官,高度近视、白内障、青光眼、黄斑病变等眼科疾病却个个致盲。老龄化、电子产品普及等因素,使眼科疾病变得越来越普遍,也让我更想要在这方面做些贡献。目前我在学好理论知识的前提下,提前接触相关的课题,尝试撰写一篇综述,是对我文献检索、信息总结、表达、思维等多方面能力的提升和锻炼,为将来不论基础还是临床,都做好充分的准备。
未来我想做一名眼科医生,医生治的不是病,而是人,做医生要对病人负责。这要求我抓住学习机会,利用好本科的几年,在专业学习上下功夫,打下坚实的理论基础,才能在未来的实践中发光发热。
相信我个人的努力,加上老师的指导,能让我完成综述写作的短期目标,为本科学习添彩,同时为实现将来的“大目标”积累经验,离梦想更进一步。